Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 168.1 ms