Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN9

Rab35, Ras-related protein Rab-35, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab35Q6PHN9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms