Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc57Q6PHN1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc57Q6PHN1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc57Q6PHN1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc57Q6PHN1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc57Q6PHN1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc57Q6PHN1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc57Q6PHN1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc57Q6PHN1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc57Q6PHN1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc57Q6PHN1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc57Q6PHN1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc57Q6PHN1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc57Q6PHN1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc57Q6PHN1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc57Q6PHN1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc57Q6PHN1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc57Q6PHN1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc57Q6PHN1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc57Q6PHN1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc57Q6PHN1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc57Q6PHN1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc57Q6PHN1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc57Q6PHN1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc57Q6PHN1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc57Q6PHN1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc57Q6PHN1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc57Q6PHN1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc57Q6PHN1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc57Q6PHN1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc57Q6PHN1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc57Q6PHN1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc57Q6PHN1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc57Q6PHN1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc57Q6PHN1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms