Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PdgfrlQ6PE55 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms