Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf1cQ6PDZ2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf1cQ6PDZ2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf1cQ6PDZ2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf1cQ6PDZ2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf1cQ6PDZ2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf1cQ6PDZ2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf1cQ6PDZ2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf1cQ6PDZ2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf1cQ6PDZ2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf1cQ6PDZ2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf1cQ6PDZ2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf1cQ6PDZ2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf1cQ6PDZ2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf1cQ6PDZ2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf1cQ6PDZ2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf1cQ6PDZ2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf1cQ6PDZ2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf1cQ6PDZ2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf1cQ6PDZ2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf1cQ6PDZ2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf1cQ6PDZ2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf1cQ6PDZ2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf1cQ6PDZ2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf1cQ6PDZ2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf1cQ6PDZ2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf1cQ6PDZ2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf1cQ6PDZ2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf1cQ6PDZ2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf1cQ6PDZ2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf1cQ6PDZ2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf1cQ6PDZ2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf1cQ6PDZ2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Taf1cQ6PDZ2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Taf1cQ6PDZ2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Taf1cQ6PDZ2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms