Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK0

Zbtb39, Zinc finger and BTB domain-containing 39, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb39Q6PDK0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Zbtb39Q6PDK0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Zbtb39Q6PDK0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zbtb39Q6PDK0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zbtb39Q6PDK0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zbtb39Q6PDK0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zbtb39Q6PDK0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zbtb39Q6PDK0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zbtb39Q6PDK0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zbtb39Q6PDK0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zbtb39Q6PDK0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zbtb39Q6PDK0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zbtb39Q6PDK0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zbtb39Q6PDK0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zbtb39Q6PDK0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zbtb39Q6PDK0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zbtb39Q6PDK0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zbtb39Q6PDK0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zbtb39Q6PDK0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zbtb39Q6PDK0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zbtb39Q6PDK0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zbtb39Q6PDK0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zbtb39Q6PDK0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zbtb39Q6PDK0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zbtb39Q6PDK0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms