Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAM0

Prkab2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab2Q6PAM0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms