Protein–RNA interactions for Protein: Q6P539

Fam222b, Protein FAM222B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam222bQ6P539 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms