Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms