Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZK8

Ptpdc1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptpdc1Q6NZK8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ptpdc1Q6NZK8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ptpdc1Q6NZK8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ptpdc1Q6NZK8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms