Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI8

Cxxc4, CXXC-type zinc finger protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc4Q6NXI8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms