Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SphkapQ6NSW3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SphkapQ6NSW3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SphkapQ6NSW3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SphkapQ6NSW3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SphkapQ6NSW3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SphkapQ6NSW3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SphkapQ6NSW3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SphkapQ6NSW3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SphkapQ6NSW3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SphkapQ6NSW3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SphkapQ6NSW3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SphkapQ6NSW3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SphkapQ6NSW3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SphkapQ6NSW3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SphkapQ6NSW3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SphkapQ6NSW3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SphkapQ6NSW3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SphkapQ6NSW3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SphkapQ6NSW3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SphkapQ6NSW3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SphkapQ6NSW3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SphkapQ6NSW3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SphkapQ6NSW3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SphkapQ6NSW3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SphkapQ6NSW3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SphkapQ6NSW3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SphkapQ6NSW3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SphkapQ6NSW3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SphkapQ6NSW3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SphkapQ6NSW3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SphkapQ6NSW3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SphkapQ6NSW3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SphkapQ6NSW3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SphkapQ6NSW3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SphkapQ6NSW3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SphkapQ6NSW3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SphkapQ6NSW3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SphkapQ6NSW3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SphkapQ6NSW3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SphkapQ6NSW3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SphkapQ6NSW3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SphkapQ6NSW3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SphkapQ6NSW3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SphkapQ6NSW3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SphkapQ6NSW3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SphkapQ6NSW3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SphkapQ6NSW3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SphkapQ6NSW3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SphkapQ6NSW3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SphkapQ6NSW3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SphkapQ6NSW3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SphkapQ6NSW3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SphkapQ6NSW3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SphkapQ6NSW3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SphkapQ6NSW3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SphkapQ6NSW3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SphkapQ6NSW3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SphkapQ6NSW3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SphkapQ6NSW3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SphkapQ6NSW3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SphkapQ6NSW3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SphkapQ6NSW3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SphkapQ6NSW3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SphkapQ6NSW3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SphkapQ6NSW3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SphkapQ6NSW3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SphkapQ6NSW3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SphkapQ6NSW3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SphkapQ6NSW3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SphkapQ6NSW3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SphkapQ6NSW3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SphkapQ6NSW3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SphkapQ6NSW3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SphkapQ6NSW3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SphkapQ6NSW3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SphkapQ6NSW3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SphkapQ6NSW3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SphkapQ6NSW3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SphkapQ6NSW3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SphkapQ6NSW3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SphkapQ6NSW3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SphkapQ6NSW3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SphkapQ6NSW3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SphkapQ6NSW3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SphkapQ6NSW3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SphkapQ6NSW3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SphkapQ6NSW3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SphkapQ6NSW3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SphkapQ6NSW3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SphkapQ6NSW3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SphkapQ6NSW3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SphkapQ6NSW3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SphkapQ6NSW3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SphkapQ6NSW3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SphkapQ6NSW3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SphkapQ6NSW3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SphkapQ6NSW3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SphkapQ6NSW3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SphkapQ6NSW3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms