Protein–RNA interactions for Protein: Q6IR41

C1qtnf6, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf6Q6IR41 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1qtnf6Q6IR41 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1qtnf6Q6IR41 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1qtnf6Q6IR41 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1qtnf6Q6IR41 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1qtnf6Q6IR41 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1qtnf6Q6IR41 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1qtnf6Q6IR41 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1qtnf6Q6IR41 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1qtnf6Q6IR41 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1qtnf6Q6IR41 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1qtnf6Q6IR41 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1qtnf6Q6IR41 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1qtnf6Q6IR41 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1qtnf6Q6IR41 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1qtnf6Q6IR41 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1qtnf6Q6IR41 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1qtnf6Q6IR41 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C1qtnf6Q6IR41 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C1qtnf6Q6IR41 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C1qtnf6Q6IR41 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C1qtnf6Q6IR41 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C1qtnf6Q6IR41 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C1qtnf6Q6IR41 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C1qtnf6Q6IR41 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C1qtnf6Q6IR41 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C1qtnf6Q6IR41 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C1qtnf6Q6IR41 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C1qtnf6Q6IR41 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C1qtnf6Q6IR41 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C1qtnf6Q6IR41 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C1qtnf6Q6IR41 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C1qtnf6Q6IR41 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1qtnf6Q6IR41 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1qtnf6Q6IR41 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1qtnf6Q6IR41 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1qtnf6Q6IR41 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1qtnf6Q6IR41 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
C1qtnf6Q6IR41 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1qtnf6Q6IR41 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1qtnf6Q6IR41 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1qtnf6Q6IR41 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1qtnf6Q6IR41 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1qtnf6Q6IR41 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1qtnf6Q6IR41 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1qtnf6Q6IR41 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1qtnf6Q6IR41 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1qtnf6Q6IR41 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1qtnf6Q6IR41 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1qtnf6Q6IR41 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1qtnf6Q6IR41 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1qtnf6Q6IR41 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1qtnf6Q6IR41 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1qtnf6Q6IR41 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1qtnf6Q6IR41 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms