Protein–RNA interactions for Protein: Q6GSS7

Hist2h2aa1, Histone H2A type 2-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hist2h2aa1Q6GSS7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hist2h2aa1Q6GSS7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hist2h2aa1Q6GSS7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms