Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG3

Spty2d1, Protein SPT2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spty2d1Q68FG3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spty2d1Q68FG3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spty2d1Q68FG3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spty2d1Q68FG3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Spty2d1Q68FG3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Spty2d1Q68FG3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Spty2d1Q68FG3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Spty2d1Q68FG3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Spty2d1Q68FG3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Spty2d1Q68FG3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Spty2d1Q68FG3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Spty2d1Q68FG3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Spty2d1Q68FG3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Spty2d1Q68FG3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms