Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab3ipQ68EF0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms