Protein–RNA interactions for Protein: Q66X05

Nlrp4f, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4F, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4fQ66X05 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nlrp4fQ66X05 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nlrp4fQ66X05 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms