Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms