Protein–RNA interactions for Protein: Q64705

Usf2, Upstream stimulatory factor 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf2Q64705 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usf2Q64705 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usf2Q64705 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usf2Q64705 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usf2Q64705 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usf2Q64705 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Usf2Q64705 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Usf2Q64705 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Usf2Q64705 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usf2Q64705 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Usf2Q64705 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usf2Q64705 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usf2Q64705 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usf2Q64705 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usf2Q64705 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usf2Q64705 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usf2Q64705 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usf2Q64705 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usf2Q64705 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usf2Q64705 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usf2Q64705 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usf2Q64705 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usf2Q64705 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usf2Q64705 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usf2Q64705 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usf2Q64705 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usf2Q64705 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usf2Q64705 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usf2Q64705 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usf2Q64705 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usf2Q64705 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Usf2Q64705 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usf2Q64705 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usf2Q64705 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usf2Q64705 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usf2Q64705 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usf2Q64705 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usf2Q64705 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usf2Q64705 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usf2Q64705 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usf2Q64705 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usf2Q64705 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usf2Q64705 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usf2Q64705 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usf2Q64705 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usf2Q64705 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Usf2Q64705 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usf2Q64705 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usf2Q64705 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usf2Q64705 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usf2Q64705 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usf2Q64705 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usf2Q64705 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usf2Q64705 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usf2Q64705 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usf2Q64705 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usf2Q64705 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usf2Q64705 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usf2Q64705 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usf2Q64705 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usf2Q64705 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Usf2Q64705 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Usf2Q64705 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usf2Q64705 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usf2Q64705 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usf2Q64705 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usf2Q64705 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usf2Q64705 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms