Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Top2bQ64511 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Top2bQ64511 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Top2bQ64511 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Top2bQ64511 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Top2bQ64511 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Top2bQ64511 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Top2bQ64511 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Top2bQ64511 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Top2bQ64511 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Top2bQ64511 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Top2bQ64511 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Top2bQ64511 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Top2bQ64511 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Top2bQ64511 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Top2bQ64511 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Top2bQ64511 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Top2bQ64511 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Top2bQ64511 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Top2bQ64511 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Top2bQ64511 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Top2bQ64511 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Top2bQ64511 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Top2bQ64511 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Top2bQ64511 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Top2bQ64511 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Top2bQ64511 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Top2bQ64511 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Top2bQ64511 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Top2bQ64511 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Top2bQ64511 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Top2bQ64511 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Top2bQ64511 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Top2bQ64511 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Top2bQ64511 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Top2bQ64511 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Top2bQ64511 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Top2bQ64511 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Top2bQ64511 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Top2bQ64511 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms