Protein–RNA interactions for Protein: Q64336

Tbr1, T-box brain protein 1, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbr1Q64336 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Tbr1Q64336 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Tbr1Q64336 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Tbr1Q64336 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Tbr1Q64336 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Tbr1Q64336 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbr1Q64336 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbr1Q64336 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tbr1Q64336 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tbr1Q64336 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tbr1Q64336 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbr1Q64336 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tbr1Q64336 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Tbr1Q64336 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbr1Q64336 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbr1Q64336 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbr1Q64336 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbr1Q64336 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbr1Q64336 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbr1Q64336 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbr1Q64336 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Tbr1Q64336 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbr1Q64336 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbr1Q64336 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbr1Q64336 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbr1Q64336 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbr1Q64336 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbr1Q64336 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbr1Q64336 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbr1Q64336 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbr1Q64336 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbr1Q64336 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbr1Q64336 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbr1Q64336 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbr1Q64336 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbr1Q64336 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbr1Q64336 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbr1Q64336 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbr1Q64336 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbr1Q64336 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms