Protein–RNA interactions for Protein: Q64221

Nhlh2, Helix-loop-helix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh2Q64221 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlh2Q64221 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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