Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

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Length 837 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pan3Q640Q5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.5 ms