Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc18Q640L5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc18Q640L5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc18Q640L5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc18Q640L5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc18Q640L5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc18Q640L5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc18Q640L5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc18Q640L5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc18Q640L5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc18Q640L5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc18Q640L5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc18Q640L5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc18Q640L5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc18Q640L5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc18Q640L5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc18Q640L5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc18Q640L5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc18Q640L5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc18Q640L5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc18Q640L5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc18Q640L5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc18Q640L5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc18Q640L5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc18Q640L5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc18Q640L5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc18Q640L5 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc18Q640L5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc18Q640L5 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc18Q640L5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc18Q640L5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc18Q640L5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc18Q640L5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc18Q640L5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc18Q640L5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc18Q640L5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc18Q640L5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc18Q640L5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc18Q640L5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc18Q640L5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc18Q640L5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc18Q640L5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc18Q640L5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc18Q640L5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc18Q640L5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc18Q640L5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc18Q640L5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc18Q640L5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Ccdc18Q640L5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Ccdc18Q640L5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc18Q640L5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc18Q640L5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc18Q640L5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc18Q640L5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc18Q640L5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc18Q640L5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc18Q640L5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc18Q640L5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc18Q640L5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc18Q640L5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc18Q640L5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc18Q640L5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc18Q640L5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc18Q640L5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc18Q640L5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc18Q640L5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc18Q640L5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc18Q640L5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc18Q640L5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc18Q640L5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
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Ccdc18Q640L5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc18Q640L5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc18Q640L5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc18Q640L5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc18Q640L5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc18Q640L5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc18Q640L5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc18Q640L5 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc18Q640L5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc18Q640L5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc18Q640L5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc18Q640L5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc18Q640L5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc18Q640L5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc18Q640L5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc18Q640L5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc18Q640L5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc18Q640L5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc18Q640L5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc18Q640L5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc18Q640L5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc18Q640L5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc18Q640L5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc18Q640L5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc18Q640L5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc18Q640L5 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc18Q640L5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc18Q640L5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc18Q640L5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
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