Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ift52Q62559 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms