Protein–RNA interactions for Protein: Q62472

Lcn4, Vomeronasal secretory protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn4Q62472 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcn4Q62472 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcn4Q62472 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcn4Q62472 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcn4Q62472 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcn4Q62472 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcn4Q62472 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcn4Q62472 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcn4Q62472 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcn4Q62472 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcn4Q62472 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcn4Q62472 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcn4Q62472 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcn4Q62472 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcn4Q62472 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcn4Q62472 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn4Q62472 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn4Q62472 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn4Q62472 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn4Q62472 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn4Q62472 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn4Q62472 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn4Q62472 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn4Q62472 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn4Q62472 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn4Q62472 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn4Q62472 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn4Q62472 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn4Q62472 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn4Q62472 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn4Q62472 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn4Q62472 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn4Q62472 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn4Q62472 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcn4Q62472 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcn4Q62472 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcn4Q62472 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcn4Q62472 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcn4Q62472 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcn4Q62472 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcn4Q62472 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcn4Q62472 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcn4Q62472 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcn4Q62472 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcn4Q62472 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcn4Q62472 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcn4Q62472 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcn4Q62472 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcn4Q62472 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcn4Q62472 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcn4Q62472 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcn4Q62472 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcn4Q62472 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcn4Q62472 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcn4Q62472 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms