Protein–RNA interactions for Protein: Q62460

Gm20865, (clone BALB3N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20865Q62460 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20865Q62460 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms