Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CcncQ62447 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CcncQ62447 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CcncQ62447 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CcncQ62447 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CcncQ62447 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CcncQ62447 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CcncQ62447 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CcncQ62447 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CcncQ62447 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CcncQ62447 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CcncQ62447 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CcncQ62447 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CcncQ62447 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CcncQ62447 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CcncQ62447 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CcncQ62447 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CcncQ62447 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CcncQ62447 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CcncQ62447 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CcncQ62447 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CcncQ62447 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms