Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms