Protein–RNA interactions for Protein: Q62425

Ndufa4, Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa4Q62425 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ndufa4Q62425 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ndufa4Q62425 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ndufa4Q62425 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ndufa4Q62425 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ndufa4Q62425 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufa4Q62425 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufa4Q62425 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufa4Q62425 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufa4Q62425 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufa4Q62425 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufa4Q62425 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufa4Q62425 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufa4Q62425 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufa4Q62425 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufa4Q62425 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufa4Q62425 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufa4Q62425 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufa4Q62425 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufa4Q62425 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufa4Q62425 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufa4Q62425 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufa4Q62425 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufa4Q62425 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufa4Q62425 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufa4Q62425 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufa4Q62425 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufa4Q62425 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ndufa4Q62425 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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