Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Hoxa13Q62424 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Hoxa13Q62424 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Hoxa13Q62424 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms