Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TrhQ62361 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TrhQ62361 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TrhQ62361 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TrhQ62361 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TrhQ62361 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TrhQ62361 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
TrhQ62361 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TrhQ62361 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TrhQ62361 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TrhQ62361 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TrhQ62361 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TrhQ62361 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TrhQ62361 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TrhQ62361 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TrhQ62361 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TrhQ62361 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms