Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim28Q62318 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim28Q62318 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim28Q62318 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim28Q62318 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim28Q62318 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim28Q62318 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim28Q62318 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim28Q62318 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim28Q62318 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim28Q62318 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim28Q62318 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim28Q62318 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim28Q62318 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim28Q62318 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim28Q62318 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim28Q62318 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim28Q62318 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim28Q62318 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim28Q62318 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trim28Q62318 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim28Q62318 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim28Q62318 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim28Q62318 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim28Q62318 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim28Q62318 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim28Q62318 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim28Q62318 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim28Q62318 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim28Q62318 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim28Q62318 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim28Q62318 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms