Protein–RNA interactions for Protein: Q62283

Tspan7, Tetraspanin-7, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan7Q62283 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan7Q62283 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan7Q62283 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan7Q62283 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan7Q62283 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan7Q62283 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan7Q62283 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan7Q62283 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan7Q62283 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan7Q62283 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan7Q62283 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan7Q62283 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan7Q62283 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan7Q62283 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan7Q62283 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan7Q62283 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan7Q62283 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan7Q62283 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan7Q62283 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan7Q62283 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan7Q62283 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan7Q62283 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan7Q62283 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan7Q62283 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan7Q62283 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan7Q62283 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan7Q62283 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan7Q62283 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan7Q62283 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan7Q62283 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan7Q62283 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan7Q62283 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan7Q62283 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan7Q62283 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan7Q62283 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan7Q62283 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan7Q62283 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan7Q62283 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan7Q62283 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan7Q62283 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan7Q62283 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan7Q62283 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan7Q62283 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan7Q62283 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan7Q62283 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan7Q62283 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan7Q62283 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan7Q62283 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan7Q62283 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan7Q62283 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan7Q62283 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan7Q62283 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan7Q62283 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan7Q62283 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan7Q62283 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan7Q62283 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan7Q62283 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan7Q62283 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan7Q62283 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan7Q62283 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan7Q62283 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan7Q62283 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan7Q62283 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan7Q62283 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan7Q62283 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan7Q62283 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan7Q62283 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan7Q62283 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan7Q62283 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan7Q62283 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan7Q62283 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan7Q62283 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan7Q62283 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan7Q62283 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan7Q62283 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan7Q62283 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan7Q62283 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan7Q62283 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan7Q62283 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan7Q62283 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan7Q62283 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan7Q62283 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan7Q62283 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan7Q62283 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan7Q62283 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan7Q62283 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan7Q62283 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan7Q62283 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan7Q62283 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan7Q62283 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan7Q62283 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan7Q62283 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan7Q62283 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan7Q62283 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan7Q62283 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan7Q62283 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan7Q62283 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan7Q62283 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan7Q62283 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan7Q62283 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms