Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
Kdm5dQ62240 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Kdm5dQ62240 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Kdm5dQ62240 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Kdm5dQ62240 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Kdm5dQ62240 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Kdm5dQ62240 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Kdm5dQ62240 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Kdm5dQ62240 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
Kdm5dQ62240 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
Kdm5dQ62240 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Kdm5dQ62240 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Kdm5dQ62240 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Kdm5dQ62240 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Kdm5dQ62240 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Kdm5dQ62240 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Kdm5dQ62240 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Kdm5dQ62240 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Kdm5dQ62240 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Kdm5dQ62240 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Kdm5dQ62240 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Kdm5dQ62240 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Kdm5dQ62240 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Kdm5dQ62240 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Kdm5dQ62240 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Kdm5dQ62240 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Kdm5dQ62240 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Kdm5dQ62240 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Kdm5dQ62240 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Kdm5dQ62240 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Kdm5dQ62240 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Kdm5dQ62240 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Kdm5dQ62240 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Kdm5dQ62240 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Kdm5dQ62240 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Kdm5dQ62240 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
Kdm5dQ62240 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Kdm5dQ62240 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Kdm5dQ62240 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Kdm5dQ62240 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Kdm5dQ62240 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Kdm5dQ62240 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Kdm5dQ62240 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Kdm5dQ62240 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Kdm5dQ62240 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Kdm5dQ62240 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Kdm5dQ62240 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Kdm5dQ62240 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Kdm5dQ62240 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Kdm5dQ62240 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Kdm5dQ62240 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Kdm5dQ62240 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Kdm5dQ62240 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Kdm5dQ62240 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Kdm5dQ62240 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Kdm5dQ62240 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Kdm5dQ62240 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
Kdm5dQ62240 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Kdm5dQ62240 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Kdm5dQ62240 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Kdm5dQ62240 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Kdm5dQ62240 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
Kdm5dQ62240 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Kdm5dQ62240 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Kdm5dQ62240 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Kdm5dQ62240 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Kdm5dQ62240 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Kdm5dQ62240 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Kdm5dQ62240 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Kdm5dQ62240 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Kdm5dQ62240 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Kdm5dQ62240 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Kdm5dQ62240 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Kdm5dQ62240 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Kdm5dQ62240 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Kdm5dQ62240 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Kdm5dQ62240 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Kdm5dQ62240 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Kdm5dQ62240 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Kdm5dQ62240 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Kdm5dQ62240 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Kdm5dQ62240 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Kdm5dQ62240 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Kdm5dQ62240 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Kdm5dQ62240 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Kdm5dQ62240 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Kdm5dQ62240 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Kdm5dQ62240 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Kdm5dQ62240 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Kdm5dQ62240 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Kdm5dQ62240 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Kdm5dQ62240 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Kdm5dQ62240 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Kdm5dQ62240 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Kdm5dQ62240 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Kdm5dQ62240 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Kdm5dQ62240 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Kdm5dQ62240 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Kdm5dQ62240 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Kdm5dQ62240 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms