Protein–RNA interactions for Protein: Q62159

Rhoc, Rho-related GTP-binding protein RhoC, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhocQ62159 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RhocQ62159 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RhocQ62159 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RhocQ62159 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RhocQ62159 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RhocQ62159 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RhocQ62159 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RhocQ62159 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RhocQ62159 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RhocQ62159 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RhocQ62159 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RhocQ62159 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RhocQ62159 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RhocQ62159 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RhocQ62159 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RhocQ62159 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RhocQ62159 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RhocQ62159 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RhocQ62159 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RhocQ62159 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RhocQ62159 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RhocQ62159 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RhocQ62159 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RhocQ62159 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RhocQ62159 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RhocQ62159 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RhocQ62159 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RhocQ62159 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RhocQ62159 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RhocQ62159 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RhocQ62159 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RhocQ62159 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RhocQ62159 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RhocQ62159 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RhocQ62159 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RhocQ62159 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RhocQ62159 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RhocQ62159 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RhocQ62159 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RhocQ62159 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RhocQ62159 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RhocQ62159 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RhocQ62159 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RhocQ62159 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RhocQ62159 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RhocQ62159 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RhocQ62159 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RhocQ62159 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RhocQ62159 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RhocQ62159 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RhocQ62159 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RhocQ62159 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RhocQ62159 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RhocQ62159 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RhocQ62159 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RhocQ62159 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RhocQ62159 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RhocQ62159 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RhocQ62159 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RhocQ62159 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RhocQ62159 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RhocQ62159 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RhocQ62159 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RhocQ62159 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RhocQ62159 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RhocQ62159 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms