Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf1Q61999 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf1Q61999 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf1Q61999 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf1Q61999 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf1Q61999 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf1Q61999 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf1Q61999 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf1Q61999 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf1Q61999 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf1Q61999 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf1Q61999 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf1Q61999 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf1Q61999 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Odf1Q61999 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Odf1Q61999 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Odf1Q61999 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Odf1Q61999 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Odf1Q61999 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Odf1Q61999 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf1Q61999 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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