Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AtrxQ61687 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AtrxQ61687 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AtrxQ61687 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AtrxQ61687 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AtrxQ61687 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AtrxQ61687 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AtrxQ61687 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AtrxQ61687 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AtrxQ61687 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AtrxQ61687 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AtrxQ61687 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AtrxQ61687 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AtrxQ61687 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AtrxQ61687 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AtrxQ61687 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AtrxQ61687 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AtrxQ61687 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AtrxQ61687 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AtrxQ61687 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AtrxQ61687 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AtrxQ61687 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AtrxQ61687 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AtrxQ61687 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AtrxQ61687 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AtrxQ61687 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AtrxQ61687 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
AtrxQ61687 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms