Protein–RNA interactions for Protein: Q61526

Erbb3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erbb3Q61526 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Erbb3Q61526 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Erbb3Q61526 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Erbb3Q61526 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Erbb3Q61526 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Erbb3Q61526 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Erbb3Q61526 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Erbb3Q61526 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Erbb3Q61526 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Erbb3Q61526 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Erbb3Q61526 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Erbb3Q61526 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Erbb3Q61526 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Erbb3Q61526 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Erbb3Q61526 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Erbb3Q61526 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Erbb3Q61526 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Erbb3Q61526 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Erbb3Q61526 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Erbb3Q61526 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Erbb3Q61526 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Erbb3Q61526 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Erbb3Q61526 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Erbb3Q61526 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Erbb3Q61526 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Erbb3Q61526 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Erbb3Q61526 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Erbb3Q61526 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Erbb3Q61526 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Erbb3Q61526 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Erbb3Q61526 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Erbb3Q61526 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Erbb3Q61526 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Erbb3Q61526 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Erbb3Q61526 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Erbb3Q61526 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Erbb3Q61526 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Erbb3Q61526 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Erbb3Q61526 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Erbb3Q61526 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Erbb3Q61526 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Erbb3Q61526 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Erbb3Q61526 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Erbb3Q61526 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Erbb3Q61526 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Erbb3Q61526 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Erbb3Q61526 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Erbb3Q61526 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Erbb3Q61526 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Erbb3Q61526 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Erbb3Q61526 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Erbb3Q61526 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Erbb3Q61526 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Erbb3Q61526 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Erbb3Q61526 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Erbb3Q61526 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Erbb3Q61526 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Erbb3Q61526 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Erbb3Q61526 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Erbb3Q61526 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Erbb3Q61526 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Erbb3Q61526 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Erbb3Q61526 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Erbb3Q61526 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Erbb3Q61526 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Erbb3Q61526 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Erbb3Q61526 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Erbb3Q61526 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Erbb3Q61526 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Erbb3Q61526 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Erbb3Q61526 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Erbb3Q61526 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Erbb3Q61526 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Erbb3Q61526 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Erbb3Q61526 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Erbb3Q61526 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Erbb3Q61526 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Erbb3Q61526 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Erbb3Q61526 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Erbb3Q61526 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Erbb3Q61526 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Erbb3Q61526 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Erbb3Q61526 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Erbb3Q61526 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Erbb3Q61526 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Erbb3Q61526 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Erbb3Q61526 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Erbb3Q61526 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Erbb3Q61526 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Erbb3Q61526 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Erbb3Q61526 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Erbb3Q61526 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Erbb3Q61526 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Erbb3Q61526 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Erbb3Q61526 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Erbb3Q61526 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Erbb3Q61526 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Erbb3Q61526 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Erbb3Q61526 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Erbb3Q61526 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms