Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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PcolceQ61398 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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