Protein–RNA interactions for Protein: Q61271

Acvr1b, Activin receptor type-1B, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acvr1bQ61271 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acvr1bQ61271 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acvr1bQ61271 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acvr1bQ61271 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acvr1bQ61271 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acvr1bQ61271 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acvr1bQ61271 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acvr1bQ61271 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acvr1bQ61271 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acvr1bQ61271 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acvr1bQ61271 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acvr1bQ61271 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acvr1bQ61271 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acvr1bQ61271 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acvr1bQ61271 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Acvr1bQ61271 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acvr1bQ61271 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acvr1bQ61271 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acvr1bQ61271 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acvr1bQ61271 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acvr1bQ61271 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acvr1bQ61271 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acvr1bQ61271 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acvr1bQ61271 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acvr1bQ61271 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acvr1bQ61271 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acvr1bQ61271 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acvr1bQ61271 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acvr1bQ61271 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acvr1bQ61271 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acvr1bQ61271 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acvr1bQ61271 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acvr1bQ61271 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acvr1bQ61271 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acvr1bQ61271 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acvr1bQ61271 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acvr1bQ61271 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acvr1bQ61271 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acvr1bQ61271 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Acvr1bQ61271 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acvr1bQ61271 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acvr1bQ61271 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acvr1bQ61271 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acvr1bQ61271 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acvr1bQ61271 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acvr1bQ61271 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acvr1bQ61271 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acvr1bQ61271 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Acvr1bQ61271 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms