Protein–RNA interactions for Protein: Q61179

Irf9, Interferon regulatory factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf9Q61179 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Irf9Q61179 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms