Protein–RNA interactions for Protein: Q61033

Tmpo, Lamina-associated polypeptide 2, isoforms alpha/zeta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TmpoQ61033 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TmpoQ61033 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TmpoQ61033 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TmpoQ61033 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TmpoQ61033 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TmpoQ61033 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TmpoQ61033 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TmpoQ61033 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TmpoQ61033 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TmpoQ61033 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TmpoQ61033 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TmpoQ61033 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TmpoQ61033 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms