Protein–RNA interactions for Protein: Q61010

Dtx1, E3 ubiquitin-protein ligase DTX1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx1Q61010 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dtx1Q61010 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms