Protein–RNA interactions for Protein: Q60987

Foxg1, Forkhead box protein G1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxg1Q60987 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms