Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms