Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp4Q60972 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms