Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms