Protein–RNA interactions for Protein: Q60696

Pmel, Melanocyte protein PMEL, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmelQ60696 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PmelQ60696 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PmelQ60696 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PmelQ60696 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PmelQ60696 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PmelQ60696 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PmelQ60696 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PmelQ60696 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PmelQ60696 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PmelQ60696 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PmelQ60696 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PmelQ60696 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PmelQ60696 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PmelQ60696 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PmelQ60696 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PmelQ60696 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PmelQ60696 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PmelQ60696 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PmelQ60696 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PmelQ60696 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PmelQ60696 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PmelQ60696 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PmelQ60696 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PmelQ60696 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PmelQ60696 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PmelQ60696 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PmelQ60696 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PmelQ60696 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PmelQ60696 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PmelQ60696 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PmelQ60696 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PmelQ60696 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PmelQ60696 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PmelQ60696 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PmelQ60696 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PmelQ60696 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PmelQ60696 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PmelQ60696 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PmelQ60696 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PmelQ60696 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PmelQ60696 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PmelQ60696 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PmelQ60696 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PmelQ60696 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PmelQ60696 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PmelQ60696 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PmelQ60696 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PmelQ60696 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PmelQ60696 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PmelQ60696 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PmelQ60696 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PmelQ60696 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PmelQ60696 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PmelQ60696 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PmelQ60696 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PmelQ60696 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PmelQ60696 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PmelQ60696 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms