Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprnQ60673 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprnQ60673 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprnQ60673 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprnQ60673 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprnQ60673 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprnQ60673 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprnQ60673 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprnQ60673 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprnQ60673 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprnQ60673 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprnQ60673 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprnQ60673 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprnQ60673 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprnQ60673 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprnQ60673 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprnQ60673 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprnQ60673 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprnQ60673 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprnQ60673 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprnQ60673 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprnQ60673 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprnQ60673 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprnQ60673 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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PtprnQ60673 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprnQ60673 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprnQ60673 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprnQ60673 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprnQ60673 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprnQ60673 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprnQ60673 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprnQ60673 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PtprnQ60673 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PtprnQ60673 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PtprnQ60673 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PtprnQ60673 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprnQ60673 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprnQ60673 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprnQ60673 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprnQ60673 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprnQ60673 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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PtprnQ60673 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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PtprnQ60673 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprnQ60673 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprnQ60673 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprnQ60673 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprnQ60673 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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PtprnQ60673 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprnQ60673 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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PtprnQ60673 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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PtprnQ60673 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprnQ60673 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprnQ60673 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprnQ60673 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprnQ60673 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprnQ60673 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprnQ60673 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprnQ60673 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprnQ60673 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprnQ60673 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprnQ60673 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprnQ60673 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprnQ60673 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprnQ60673 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprnQ60673 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprnQ60673 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprnQ60673 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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PtprnQ60673 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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